FiBL MicroResp Applikation

Die FiBL MicroResp Applikation vereinfacht die Auswertung von MicroResp-Daten, von Import und Normalisierung bis zur Indexberechnung. Ergebnisse lassen sich einfach als CSV exportieren und weiterverarbeiten

Ausgangslage

Das Forschungsinstitut für biologischen Landbau (FiBL) setzt die MicroResp-Methode ein, um die Bodenqualität landwirtschaftlicher Anbauflächen zu untersuchen. Dabei fallen umfangreiche Messdaten aus Feld- und Laborversuchen an.

Die Verarbeitung dieser Daten erfolgte bisher manuell mit Excel-Tabellen. Dieser Ansatz ist zeitintensiv, fehleranfällig und erschwert die Nachvollziehbarkeit der einzelnen Verarbeitungsschritte sowie die Wiederverwendbarkeit der Ergebnisse für wissenschaftliche Publikationen.

Zielsetzung

Ziel des Projekts war die Entwicklung einer spezialisierten Webapplikation zur digitalen Unterstützung der FiBL-Wissenschaftlerinnen und -Wissenschaftler bei der Erfassung, Bewirtschaftung und Auswertung von MicroResp-Messdaten.

Die Anwendung soll den gesamten Datenverarbeitungsprozess – vom Import der Rohdaten über die Normalisierung und Ausreisser-Selektion bis hin zur Aggregation und zum Export – automatisieren, vereinfachen und reproduzierbar machen.

Ergebnisse

Im Rahmen des Projekts wurde eine Webapplikation entwickelt, die den vollständigen Verarbeitungsworkflow von MicroResp-Messdaten digital abbildet. Die Anwendung ermöglicht den strukturierten Import von Rohdaten, führt sämtliche Normalisierungs- und Berechnungsschritte automatisch durch und speichert alle Zwischenergebnisse nachvollziehbar im Dateisystem.

Ein zentrales Ergebnis ist die interaktive Ausreisser-Selektion, bei der Messwerte visuell überprüft und gezielt ausgeschlossen werden können. Dieser Schritt erhöht die Datenqualität und verbessert die Transparenz gegenüber rein automatisierten Verfahren.

Die Applikation berechnet automatisch relevante wissenschaftliche Kennzahlen wie MSIR (Multiple Substrate Induced Respiration), relative Respirationsanteile sowie den Shannon-Index. Die aggregierten Ergebnisse können projektweise als CSV exportiert und direkt für weiterführende Analysen oder wissenschaftliche Publikationen verwendet werden.

Durch die Automatisierung und Standardisierung der Datenverarbeitung wird der manuelle Aufwand deutlich reduziert, die Fehleranfälligkeit minimiert und die Reproduzierbarkeit der Ergebnisse nachhaltig verbessert.

Verwendete Technologien

• PythonProgrammiersprache zur Umsetzung der Businesslogik und API-Definitionen
• FastAPIWeb-Framework zur Erstellung von REST-APIs
• UvicornASGI-Server zur Ausführung von FastAPI-Anwendungen
• Jinja2Template-Engine zur Erstellung dynamischer HTML-Seiten

Kunde

FiBL Schweiz
Ackerstrasse 113
CH-5070 Frick
Link zum Unternehmen

Team