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Segmentation of Wrist Fractures

Project Image KSBL
Zusammenfassung

Frakturen im Handgelenksbereich gehören zu den häufigsten unfallbedingten Verletzungen, welche in der Handchirurgie behandelt werden müssen. Für die Diagnose werden standardmässig Röntgenbilder der Handgelenksknochen erfasst. Die Interpretation bedarf erfahrene Radiologen und kann teilweise subjektiv sein. Aus insgesamt 729 Röntgenbilder konnte ein Deep Learning Segmentierungsmodell erstellt werden, dass Frakturlinien erkennen kann.

Schlüsselbegriffe

Python, PyTorch, Data Science, Deep Learning, Computer Vision, Segmentierung, Handgelenk, Fraktur

Zielsetzung

In diesem Projekt soll ein Ansatz zur Klassifikation pro Pixel mittels Segmentierungsmodellen entwickelt werden. Da bestehende Segmentierungsmodelle Probleme mit sehr dünnen Segmenten (Frakturlinien) haben, soll dafür ausserdem eine passende Label- oder modellbasierte Lösung gefunden werden.

Ausgangslage

Frakturen im Handgelenksbereich gehören zu den häufigsten unfallbedingten Verletzungen, welche in der Handchirurgie behandelt werden müssen. Für die Diagnose werden standardmässig Röntgenbilder der Handgelenksknochen erfasst. Neben der Diagnostik und der Abklärung von Behandlungsoptionen dienen diese dem Chirurgen auch als wichtige Informationsquelle bei allfälligen Operationen. Deep Learning und insbesondere Convolutional Neural Networks (CNNs) haben sich in den letzten Jahren in der Bild- und Objekterkennung als State-of-the-Art etabliert. Von besonderem Interesse sind dabei Segmentierungsnetzwerke, welche zum Ziel haben, eine pixelweise Klassifikation von Gewebearten vorzunehmen – oder von Bruchzonen in Handgelenken. In Zusammenarbeit mit Handchirurgen vom Kantonsspital Baselland (KSBL) wurde in zwei vorhergehenden Studierendenarbeiten die Machbarkeit der Erkennung von Handgelenksbrüchen mittels Deep Learning auf Röntgenaufnahmen geprüft. Mittels Modelle zur Bild-Klassifikation oder zur Objekterkennung in Bildern konnte gezeigt werden, dass die Erkennung von Brüchen prinzipiell möglich ist.

Ergebnisse

Im Rahmen dieses Projekts konnte erfolgreich gezeigt werden, dass Segmentierungsmodelle (U-Net, Mask R-CNN) dünne Frakturlinien im Handgelenkbereich erkennen können. Die Arbeit zeigt weiter die Schwierigkeit der Evaluation von Segmentierungsmodellen auf. Eine visuelle Inspektion der Segmentierung hat sich als Ergänzung als nützlich erwiesen.

Projektdaten

Projektdauer: 1. Semester, Arbeitsaufwand: 6 ETCS (180 STD), Team: 2 Personen

Auftraggeber
KSBL Logo

Kantonsspital Baselland, Rheinstrasse 26, Liestal

Projektteam

Joel Grosjean (Data Science)

Manuel Schwarz (Data Science)

Kontakt

Prof. Dr. Martin Melchior

Dr. Cedric Huwyler

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